东京大学:新冠病毒出现变异体 导致症状加重(组图)

东京大学医学科学研究所国际传染病中心佐藤佳准(Kei Sato)教授 的最新研究显示, SARS-CoV-2 ORF3b是有效的干扰素拮抗剂,且拮抗能力与ORF3b蛋白长度相关,比其在SARS-CoV中的直系同源物能更有效地抑制诱导I型干扰素(IFN-I) 。

通过系统发育和功能分析,发现蝙蝠和穿山甲的SARS-CoV-2相关病毒也存在编码 不同长度的ORF3b蛋白,并具有很强的抗干扰素能力 。此外,通过对15,000多个SARS-CoV-2序列分析,发现了一个 自然变异体可导致更长的ORF3b蛋白产生 。

从两名患有严重COVID-19疾病的患者中 分离出该变异体 ,发现更长的ORF3b可更强的抑制干扰素应答能力。该发现不仅有助于解释COVID-19患者的不良干扰素反应,而且还表明延长的ORF3b可能加剧COVID-19症状。

SARS-CoV-2感染中IFN-I应答低效的分子机制仍不清楚。在这项研究中,相关人员旨在表征决定SARS-CoV-2感染后免疫激活相关的病毒因子。特别关注病毒对IFN-I应答能力的差异,发现SARS-CoV-2和SARS-CoV的ORF3b基因产物不仅在长度上有很大差异,而且在抵抗IFN-I的能力上也有很大差异。通过对单个开放阅读框(ORF)的比较,发现SARS-CoV-2和SARS-CoV之间ORF3b的长度存在明显不同。

使用荧光素酶报告基因,研究人员在SARS-CoV-2(Wuhan-Hu-1)和SARS-CoV(Tor2)ORF3b存在的情况下检测了人IFNB1启动子的活性,在仙台病毒(SeV)感染后,所有病毒均以ORF3b剂量依赖性的抑制了IFNB1启动子的激活。值得注意的是,SARS-CoV-2 ORF3b的拮抗活性明显高于SARS-CoV ORF3b。因此,这些数据表明SARS-CoV-2 ORF3b是有效的人IFN-1激活抑制剂,即使最短的22个氨基酸的ORF3b。

蝙蝠和穿山甲病毒的SARS-CoV-2相关ORF3b蛋白平均比SARS-CoV更有效地抑制IFN-I的激活,因为SARS-CoV-2相关病毒(包括蝙蝠和穿山甲蛋白)中ORF3b蛋白的长度平均要比SARS-CoV相关病毒的长度要短。与SARS-CoV ORF3b相比,SARS-CoV-2具有4个提前终止密码子,可导致ORF3b蛋白截短表达,在蝙蝠和穿山甲的SARS-CoV-2相关病毒中也观察到了相似的模式。

由于ORF3b的长度与其抗IFN-1活性密切相关,我们假设改变SARS-CoV-2 ORF3b蛋白长度会影响其抑制人IFN-1的能力。为了验证这种可能性,研究人员构建了4个SARS-CoV-2 ORF3b突变体57 *,79 *,119 *和155 *,它们无法提前终止。

所有4种突变体均以剂量依赖性方式抑制了人IFN-1的活化。与SARS-CoV ORF3b突变体获得的结果一致。其中155 *突变体表达不佳,抑制效果不明显。但是,值得注意的是57 *,79 *,119 *表现出更高的抗IFN-I活性,这也可能解释了与SARS-CoV-和甲型流感病毒感染的细胞相比,COVID19患者和SARS-CoV-2感染的细胞的IFN应答能力差。

此外我们在GISAID数据集中筛选了SARS-CoV-2 ORF3b突变,检测到至少2个从厄瓜多尔报道的SARS-CoV-2序列,存在终止密码子丢失导致ORF3b延长。

最后,我们实验证实更长的ORF3b蛋白表现出更强的IFN抑制活性。厄瓜多尔的一名医生提供的信息,证实两名感染了上述SARS-CoV-2 ORF3b变异体 的患者均表现出 严重的COVID19疾病 ,其中一名死亡。因此,在当前大流行期间,延长型SARS-CoV-2 ORF3b变种的出现可能加剧COVID19症状。


新加坡研究称新冠患者发病11天后不再有传染力

北京时间25日消息,据外媒报道,新加坡国家传染病中心的最新研究显示,新冠肺炎患者在发病11天后不再有传染力。

新加坡国家传染病中心与新加坡医学科学院共同发表的最新研究显示,新冠肺炎患者在发病11天后不再有传染力,即便病毒检测呈阳性也无传染力。

这项研究指出,病毒检测呈阳性“不等于有传染性,也不等于病毒可以存活,在发病第11天之后,病毒既不能分离出来,也不能培养。”

这是基于对新加坡73名新冠肺炎患者的研究得出的结果。

这项研究可能会改变新加坡的解除隔离标准。目前解除隔离的标准是检测呈阴性,而不是无传染力。

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