外界一直在争论导致全球新冠肺炎大流行的SARS-CoV-2病毒的来源,尽管研究人员认为蝙蝠最有可能是SARS-CoV-2的自然宿主,但这种病毒的起源仍不清楚。
5月10日,山东第一医科大学史卫峰团队在《细胞》子刊《当代生物学》上发表了一项新研究,论文题目为“A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein”。
在论文中,研究人员描述了最近发现的一种蝙蝠冠状病毒,这种病毒在基因组某些区域是SARS-CoV-2的近亲,它在病毒突刺蛋白的S1和S2亚基的连接处以类似于SARS-CoV-2的方式插入氨基酸。
研究人员表示,虽然它不是SARS-CoV-2的直接进化前体,但这种名为RmYN02的新病毒表明,这些看似不寻常的插入事件可以在冠状病毒进化过程中自然发生。
“自从SARS-CoV-2被发现以来,许多毫无根据的言论声称该病毒来源于实验室。”山东第一医科大学病原生物学研究所所长、资深作者史卫峰说,“特别是,有人提出S1/S2插入是非常不寻常的,可能是实验室操纵的迹象。我们的论文非常清楚地表明,这些事件在野生动物中是自然发生的。这提供了强有力的证据,证明SARS-CoV-2并非实验室泄露。”
史卫峰这里提到的大概是在4月份,法国著名病毒学专家,因发现艾滋病毒(HIV-1)而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖的吕克·蒙塔尼耶教授公开支持新冠病毒系人造,他认为新冠病毒应是武汉实验室“研制艾滋病疫苗的意外产物”。
而让诺奖得主深信不疑新冠病毒是人造的依据则来源于2月份印度德里大学和印度理工学院发表在预印本bioRxiv上的一篇论文,作者发现与SARS冠状病毒相比,新冠病毒的突刺蛋白有4小段新的插入序列,而这4段插入序列都能够在艾滋病毒的蛋白序列中找到,于是认为这绝不会是自然界偶然发生的。
在印度学者的这篇发表后不久就遭到外界炮轰,直指不严谨很快被撤稿了。而现在,史卫峰的研究则发现看似不寻常的插入事件可以在冠状病毒进化过程中自然发生,为驳斥新冠病毒人为论提供有力证据。
研究人员通过分析2019年5月至10月在中国云南省收集的227个蝙蝠样本,确定了RmYN02。“自从2005年发现蝙蝠是SARS冠状病毒的宿主以来,人们就对蝙蝠作为传染病的宿主物种产生了极大的兴趣,特别是因为它们携带了非常丰富的RNA病毒,包括冠状病毒。” 史卫峰说。2020年1月初,在发现SARS-CoV-2后不久,来自样本的RNA被送往宏基因组下一代测序。
在整个基因组中,与SARS-CoV-2最接近的病毒是另一种病毒,称为RaTG13,此前在云南省的蝙蝠中发现。但在这里新发现的RmYN02病毒与SARS-CoV-2的关系更为密切,它与SARS-CoV-2在基因组的某些部分有更密切的关系,包括在基因组最长的编码段1ab中,它们共享97.2%的RNA。
研究人员注意到,RmYN02在基因组中编码关键受体结合域的区域与SARS-CoV-2用来感染宿主细胞的人类ACE2受体结合的区域并不十分类似于SAR-CoV-2。这意味着它不太可能感染人类细胞。
SARS-CoV-2和RmYN02之间的关键相似之处在于,发现RmYN02在其突刺蛋白的两个亚基相遇的地方也含有氨基酸插入。SARS-CoV-2的特征是在S1和S2的交界处插入四个氨基酸;这种插入是该病毒特有的,迄今已在所有SARS-CoV-2序列中出现。RmYN02中的插入与SARS-CoV-2中的不一样,这表明它们是通过独立的插入事件发生的。
但是,在蝙蝠身上发现的一种病毒中也发生了类似的插入事件,这有力地表明,这类插入是自然发生的。“我们的研究结果表明,这些最初看起来非常不寻常的插入事件,实际上可以自然地发生在动物β冠状病毒中。”史卫峰说。
“我们的工作进一步揭示了SARS-CoV-2的进化祖先。”他补充说,“无论是RaTG13还是RmYN02都不是SARS-CoV-2的直接祖先,因为在这些病毒之间仍然存在着进化差距。但我们的研究有力地表明,对更多野生物种的采样将揭示与SARS-CoV-2甚至其直系祖先关系更密切的病毒,这将告诉我们关于这种病毒如何在人类中出现的大量信息。”
编译/前瞻经济学人APP资讯组
原文来源:
https://phys.org/news/2020-05-relative-sars-cov-evidence-evolved-naturally.html
https://www.cell.com/current-biology/pdf/S0960-9822(20)30662-X.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS096098222030662X%3Fshowall%3Dtrue