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新冠病毒已突变!中国科研团队:已产生149个突变点
3月3日,中国科学院主办的《国家科学评论》发表《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》一文。
论文通讯作者为陆剑研究员(北京大学生命科学学院生物信息中心)、崔杰研究员(中国科学院上海巴斯德研究所)。
研究发现:新冠病毒已产生149个突变点,并演化出了两个亚型,分别是L亚型和S亚型。作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近,从而得出S型相对更古老的结论。
相对古老的S型新冠病毒应该产生更多的病毒株,因其有更多的时间在人群中传播。但基因组数据表明L型占70%,S型占30%,且每个L型病毒株比S型携带了相对较多的新生突变。作者分析了为什么相对年轻的L型新冠病毒却产生了更多的病毒株,推测L型病毒传播能力更强,或者在人体内复制更快,因此可能意味着其毒力也更大。
另外,研究发现绝大多处患者体内提取的病毒株表明其只感染了L型或S型中的一个病毒亚型。L亚型在武汉暴发的早期阶段更为普遍,但由于强力的人为干预,L亚型的发生频率在2020年1月初后有所下降。
值得注意的是,样本显示,大部分患者只感染了L亚型或S亚型中的一个。但其中一位近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株,显示其可能同时感染了L型和S型新冠病毒。不过,作者表示目前还无法排除新突变型的可能性。
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巴西发现的新冠病毒
与中国发现的病毒有所不同
据新华社,美洲新冠肺炎病例数量继续增加,美国华盛顿州卫生官员2日宣布该州又有4人死于新冠肺炎。巴西研究人员对病毒基因测序的结果显示,巴西两个确诊病例体内的病毒有所不同。
美国华盛顿州金县卫生官员杰弗里·杜钦2日在新闻发布会上说,华盛顿州又有4人死于新冠肺炎,但这4个死亡病例此前未纳入美国疾病控制和预防中心的统计。
加拿大安大略省卫生部2日宣布又确诊3例新冠肺炎病例。加拿大全国累计确诊病例数增至27例。
巴西卫生部2日最新公布的数据显示,目前巴西有2例确诊病例。巴西阿道弗·卢茨研究所和圣保罗大学医学院的研究人员对这两个病例体内的病毒进行了基因测序,结果发现首个病例体内的病毒与在德国发现的病毒更加相似,而第二个病例体内的病毒则与在英国发现的病毒更加相似。二者与在中国发现的病毒也有所不同。
据介绍,这两名患者都是今年2月在意大利感染后回到巴西的。
圣保罗大学医学院研究人员埃斯特尔·萨比诺表示,病毒出现的变异是疫情在相关地区传播留下的印记,可被研究人员用于追踪病毒传播路径。
疫情何时结束?
张文宏最新预测来了
目前来看,疫情依旧是当前最大的主题。
不少人提出,国内新增病例持续走低意味着什么?境外传播加剧该如何应对?复工和防疫要怎么权衡?层出不穷的试用药究竟如何?
近期,“网红”医生、上海医疗救治专家组组长张文宏接受采访,给出了对疫情最终发展的预测。相关话题冲上微博热搜榜。
张文宏何许人也?
张文宏,祖籍温州瑞安人。
据多个媒体报道,张文宏中学就读于浙江瑞安中学,是个学霸,高三直接保送上海医科大学,2000年获得复旦大学博士学位,随后在美国哈佛大学医学院、伊利诺伊州立大学微生物与免疫系做博士后,现任上海华山医院感染科主任。
华山医院感染科有多强?已连续九年稳居中国感染病学科榜首。
张文宏是华山医院感染科主任,中华医学会感染病学分会常委兼秘书长,中华预防医学会感染病分会副主任委员,他所领衔的华山医院感染科是国家重点学科,参与过“非典”与人感染H7N9禽流感的救治,张文宏也是上海市新型冠状病毒感染的肺炎医疗救治专家。
张文宏曾说:确诊数是零,我倒是很担心
28日,上海市新冠肺炎医疗救治专家组组长张文宏在接受中新社记者专访时说,经济复苏不代表我们现在防疫的等级或者我们的警惕性要下降。
张文宏表示:“这个时候并不是说整个城市新增病例是零就是好的,如果是零我倒是很担心的,这么多人进来怎么会是零呢。我们在这个城市发现了一例或者两例,或者三例输入性病例,我认为这都是可喜的,输入性的病例你发现的越多,我们城市就越安全。”
张文宏谈复工:不尽快复工,死亡率将高于新冠肺炎
据环球网,针对近期网络上关于复工的讨论,张文宏医生认为其中一些过度解读造成一些复工群体和城市的恐慌。大家的忧虑在于大量复工人群涌入城市是否会造成疾病的蔓延,因而有人提出索性就不要复工了。但事实上在没有疾病爆发的区域,当地人群都做了比较充分的隔离,和其他发病率低的城市其实差异并不大。如果这种交流都不能有,那城市的停滞是很难经受得起的,大家没地方买菜、不能去医院……这时候的人口死亡率反而可能会高于新冠肺炎死亡率。
张文宏医生认为,发病率低的城市复工是可以的,但也要采取措施,不要有大规模的集会。在疫情没有得到完全控制的时候,还是要戴口罩上班,勤洗手,不扎堆,电梯要经常消毒,办公空间要经常通风,只有做到这些防护条件,复工原则上才不至于会增加很大的风险。
口罩还要戴多久?
张文宏:预计1到2个月
新冠肺炎疫情防控取得了阶段性成效,上海市新冠肺炎临床救治专家组组长张文宏教授建议,大家对疫情还要保持高度警惕性,大规模聚会办不得。
张文宏医生说:“这个状态可能还要维持1到2个月。那时候没有新增了,基本上就可以把口罩摘了。”张文宏经典语录:
1.岁月这么静好,就一定有人在负重前行。谁在负重前行?就是我这样的人。
2.我跟你讲你一定是听不懂的,因为你读的书我读的书不一样。
3.一般女孩得了流感,被传染的基本都是妈妈,而丈夫很少,所以那一刻,我对爱情产生了怀疑。4.流感肺炎的死亡率是9%,SARS的死亡率只有10%,那你为什么对流感就不怕,对SARS就那么怕呢?因为SARS你一无所知。5.最好的药就是免疫力6.一线岗位全换上党员,没有讨价还价!7.防火防盗防同事!8.你在家里不是隔离,是在战斗啊!你觉得很闷,病毒也给你闷死啦。9.企业老板不用给我们捐东西,让员工在家里办公,隔离观察,还给人家发工资,这就是对国家做贡献了。10.现在不仅仅是医生一个人在战斗,那肯定完蛋。从现在开始每个人都是战士,你呆在家里你也是战士。11.不要到处瞎玩,正常生活正在慢慢回归,但是还没有到为所欲为的地步。12.专家到了这份上吧,我看了,脾气没有一个好,每个人都极端的自信,吵架是经常的。但是有一个,每个人都抱着对病人极端负责的态度。大家看到医生都是文质彬彬的,都是假的。13.当新冠大幕落下,我自然会非常silently走开。你再到华山医院来,你也很难找到我了。我就躲在角落里看书了。
14.等过了这个事情,大家该看电视的看电视,该追剧的追剧,该看跑男的看跑男,谁要看我啊?15.大家只要闷两个星期,少说话,你知道伐,语言少了,思想就出来了。所以,闷两个星期对广大的大学生,是很好的锻炼噢。16.只要今天活着就有明天治愈的希望。17.我们应该关心最本质的东西,你去吃饭会问上海菜还是山东菜,你会去问这顿饭会不会吃饱。我们最关心的是出院以后一旦复检阳性了会不会继续传染人。到目前为止,还没有出现。18.医护人员的成绩,今天在这个时间节点来看,85%的病人出院,接下去每天还会有病人出院,整体的救治成绩,我觉得对得起上海人民,我们的成绩是及格的。19.医护一体,不要忘了一线护士。
相关报道:中国科学家:新冠病毒已演化出两个亚型,毒力区别大;巴西科学家已找到突变证据
新冠病毒是否已经发生突变?如何突变?这是目前学界研究的焦点之一。
3月3日,中国科学院主办的《国家科学评论》(National Science Review)发表题为《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》的论文,通过对迄今最大规模的新冠病毒全基因组分子进化分析,揭示了新冠病毒已经演化出L和S两个亚型。其中S型是相对更古老的版本,而L亚型更具侵略性传染力更强。对不同亚型的深入了解,将有助于新冠肺炎的差异化的治疗和防控。
研究发现新冠病毒演化出两个亚型
中国科研团队最新发现显示:新冠病毒已于近期产生了149个突变点,并演化出了两个亚型,分别是L亚型和S亚型。研究发现,在地域分布及人群中的比例,这两个亚型表现出了很大测差异。
以上研究来自中国科学院主办的《国家科学评论》(National ScienceReview)于3月3日发表的论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》(On the origin andcontinuing evolution of SARS-CoV-2)。
论文通讯作者为陆剑研究员(北京大学生命科学学院生物信息中心)、崔杰研究员(中国科学院上海巴斯德研究所)。
在这103个病毒株中,有101个属于两个亚型之一。具体而言,两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点,L型是T碱基(对应亮氨酸,Leu),S型是C碱基(对应丝氨酸,Ser)。通过与其他冠状病毒比较,作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近,从而得出S型相对更古老的结论。
两种新冠病毒亚型在时间和空间分布上存在差异(图片来源:论文截图)
但研究人员意外发现,相对古老的S型新冠病毒并没有因为在人群中传播的时间更长,而感染更多的人。基因组数据表明,感染S型的比例占30%,反倒是相对年轻的L型新冠病毒的感染比例占70%,而且每个L型病毒株比S型携带了相对更多的新生突变。
基于上述反常现象,作者推测:“L型病毒传播能力更强,或者在人体内复制更快,因此可能意味着其毒力也更大。”
作者还专门比较了1月7日前后S型和L型所占比例的变化,他们发现L型在病毒株中的比例下降,S型比例上升。作者由此推测:“这可能是因为L型病毒的患者更容易表现出症状,因而更容易受到人工干预,从而使L型新冠病毒受到的负选择压力更大,感染的人数由此变少。”
103个新冠病毒毒株的进化树(图片来源:论文截图)
L亚型在武汉爆发的早期阶段更为普遍,而L亚型的发生频率在2020年1月初后有所下降。作者认为,人为干预可能对L亚型施加了更大的选择性压力,如果没有这些干预,L亚型可能更具侵略性和扩散得更快速。另一方面,由于选择压力相对较弱,在进化上较老且攻击性较小的S型可能在相对频率上有所增加。这些发现意味着,目前迫切需要结合基因组数据、流行病学数据和2019年冠状病毒病患者临床症状图表记录,进行进一步的全面研究。
103个新冠病毒毒株的衍生突变频谱分析,橘黄色为非同义突变、绿色为同义突变
(图片来源:论文截图)
另外,值得注意的是,这103个样本显示,大部分患者只感染了L亚型或S亚型中的一个。但其中一位近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株,这两个位点却均呈现了C和T的混合现象,也就是说,很有可能这位患者同时感染了L型和S型新冠病毒。不过,作者表示目前还无法排除新突变型的可能性。
巴西患者病毒基因有3处突变
巴西在2月26日出现首例确诊病例。当地科学家与英国科学家合作,紧急针对该名61岁的巴西患者进行“冠状病毒基因定序”,结果发现这名患者体内的新冠病毒同武汉公布的病毒基因相比存在3处不同,表示病毒在传播过程中已经发生突变。
据南方都市报,3月1日,一份发表在病毒学国际交流平台(Virological),题为《First report of COVID-19 in South America》(南美洲首例新型冠状病毒报告)引发关注,这是南美洲首次分析出新冠病毒的基因序列,由巴西Adolfo Lutz国家研究所、国家参考实验室,以及圣保罗大学(USP)、牛津大学热带医学研究所共同完成。
据报告介绍,该名巴西首例确诊新冠肺炎患者为61岁男性,来自圣保罗市。他于2020年2月9-21日,曾前往意大利北部的伦巴第旅游。在返回巴西后,他出现发烧和呼吸道症状,包括干咳、喉咙痛、流鼻涕等。2月25日,他在圣保罗阿尔伯特·爱因斯坦医院进行了新冠肺炎的诊断筛查,26日确诊为新冠肺炎患者。
研究人员从该名患者的鼻咽中提取病毒基因,进行“冠状病毒基因定序”,原本需要花15天的工程,在48小时内完成。
报告指出,初步的遗传分析表明,这株巴西“Brazil/SPBR1/2020”病毒的基因组,跟中国此前公布的 “Hu-1参考菌株”有3处不同,表示病毒在传播的过程中已经开始突变。而这些突变中,有两处跟德国慕尼黑群聚传染事件中提取的病毒“德国/ BavPat1/2020菌株”非常接近。这个结果表示,在欧洲传播的新冠病毒已经跟原本在中国传播的病毒有所不同。
据看看新闻,研究团队表示,目前意大利只公布了一个病毒基因组序列,来自一位东亚地区的女游客,属于 “境外输入病毒 ”。但随着确诊病例越来越多,有必要针对意大利本土病例重新进行病毒分析。“意大利北部的伦巴第地区,正好是出现第一例意大利本土病例的地方,所以我们分析的病毒基因或许可以代表新的发现,包括病毒的变异。”
研究团队将这份资料公开,希望各国能共享研究成果,避免病毒在大家不清楚其已变异的情况下传播,引发更多不确定的突变。
每日经济新闻综合
看看新闻、南方都市报、第一财经、北京晚报等
21财闻汇综合新华社、央视新闻、界面新闻、新京报、21金融圈等